มัสยิดอัลอะลา ดำเนินการก่อสร้างมาตั้งแต่ปี พ.ศ 2538 โดยได้ว่ากัฟเนื้อที่เพื่อทำการก่อสร้างมัสยิด 1 ไร่ อุทิศโดย อัลมัรฮูม ฮัจยีอับดุลเราะห์มาน อาดำ อัลมัรฮูมะห์ ฮัจยะห์ กาแย ฮัจยะห์มารียะห์ อาดำ และฮัจยี อับดุลเลาะห์ อาดำ และได้รับทะเบียนเป็นมัสยิดในปี พ.ศ 2540 หมายเลขทะเบียน 28/2540 ตั้งอยู่ที่ ซอย คลองหลวง 54 ถนนพหลโยธิน ตำบลคลองหนึ่ง อำเภอคลองหลวง จังหวัดปทุมธานี ซึ่งเมื่อก่อนหน้านี้หลายสิบปีก่อนมีอาคารมัสยิดอัลอะลา ชุมชนในคลองหนึ่งได้ประกอบศาสนกิจในทุกวันศุกร์ ณ มัสยิดแก้วนิมิตร ซึ่งเป็นมัสยิดเก่าแก่แต่เดิม แต่ด้วยความมากของสัปปุรุษ และความยากลำบากในการเดินทาง จึงเล็งเห็นว่าควรจะมีมัสยิดเพิ่มอีก 1 หลังเพื่อประกอบศาสนกิจตราบจนทุกวันนี้